Совет был образован в соответствии с Соглашением об учреждении Межправительственного совета по нефти и газу от 2 марта 1993 г., которое подписали Азербайджанская Республика, Республика Армения, Республика Беларусь, Грузия, Республика Казахстан, Кыргызская Республика, Республика Молдова, Российская Федерация, Республика Таджикистан, Республика Узбекистан и Украина. Устав Совета являлся неотъемлемой частью Соглашения.
В работе Совета принимали участие на правах стран-наблюдателей: Венгрия, Словакия, Словения, Румыния, Туркменистан, Чехия и Югославия.
Указанное Соглашение об учреждении МПСНГ являлось открытым для присоединения других государств. В 1995 году в Совет вступила Республика Хорватия. В феврале 2002 г. Советом, на основании обращения Правительства Союзной Республики Югославии, было принято решение о приеме СРЮ в полноправные члены Совета. Решение должно было вступить в силу по завершении в СРЮ внутригосударственных процедур.
Министерство иностранных дел Украины уведомило о своем намерении выйти из Соглашения об учреждении Межправительственного совета по нефти и газу (Нота № 72/36-612/4-1612 от 22 июля 2002 года).
В соответствии с Уставом высшим органом МПСНГ являлся Совет глав правительств – участников Соглашения. Государства – участники Совета были представлены в Совете руководителями национальных органов по управлению ТЭК в рангах от Министра до заместителей руководителей национальных органов по управлению нефтегазовым комплексом (Министерства топлива и энергетики, энергетики, департаменты нефти и газа, ТЭР, национальные нефтегазовые компании). В своей работе Секретариат поддерживал постоянные контакты с представителями национальных органов по управлению ТЭК стран-членов Совета, уполномоченными для оперативной работы с Советом.
В соответствии с Положением Секретариат возглавлял Руководитель Секретариата, который в период между заседаниями МПСНГ выступал и действовал как официальный представитель Совета и был вправе решать любые вопросы его текущей деятельности, за исключением тех, которые являются исключительной компетенцией заседания Совета.
Задачи и функции, которые были определены Уставом Совета:
прогнозирование путей удовлетворения потребности государств – участников Совета в нефти, газе и продуктах их переработки на перспективу 10-15 лет;
подготовка, на основе разработанных прогнозов, предложений по заключению долгосрочных межгосударственных двух- и многосторонних соглашений в области нефтяной и газовой промышленности между странами-поставщиками и странами потребителями с фиксированными согласованными объемами поставок нефти, газа и продуктов их переработки;
анализ хода выполнения заключенных долгосрочных межгосударственных соглашений;
согласование и совместная реализация приоритетных проектов в межгосударственном сотрудничестве во области нефти и газа;
разработка предложений по гармонизации национальных законодательств стран-членов Совета в области нефти и газа;
разработка основных принципов и мер, обеспечивающих экономически эффективную торговлю энергоресурсами между странами СНГ и другими странами, с учетом сложившихся транспортных связей по нефтегазопроводам и другим объектам транспортной инфраструктуры;
организация совместных научных исследований и координация работ по совместной разработке и реализации целевых программ сотрудничества в нефтяной и газовой отраслях;
координация действий в рамках единой системы нефтегазоснабжения, включая разработку соглашений о проведении согласованной политики в области транзита нефти, газа и продуктов их переработки.
За время деятельности состоялось 11 заседаний Совета, последнее было проведено 24 июня 2003 года в г. Москве в Исполнительном комитете СНГ.
28 сентября 2012 года на заседании СГП СНГ был принят Протокол об упразднении Межправительственного совета по нефти и газу, в соответствии с которым Совет прекратил свою деятельность. Вопросы сотрудничества в нефтегазовой сфере теперь рассматриваются в рамках Совета по промышленной политике государств – участников СНГ.